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DNA-Barcoding braucht eine transparente Dokumentation

In Organisms, Diversity & Evolution (Vol. 11, 2011) wird ein neuer DNA Barcode für Kieselalgen (Diatomeen) vorgeschlagen. Die am BGBM erstellten Daten wurden jetzt im Rahmen des durch das BMBF geförderten GBIF-D Projektes im Internet verfügbar gemacht.

Jonas Zimmermann, Regine Jahn und Birgit Gemeinholzer zitieren in dem Artikel die Primärdaten zur Biodiversität, die öffentlich zugänglich im Informationssystem AlgaTerra verfügbar sind. Seit 2005 werden AlgaTerra Daten in das GBIF-Netzwerk eingespeist.

Die DNA-Barcode-Entwicklung am BGBM begann mit einem Vergleich der lichtmikroskopischen und molekularen Identifikation von Diatomeen aus dem Berliner Tegeler See.

Hantzschia amphioxys clone, used for barcoding

Hantzschia amphioxys (REM, Lichtmikroskop). Fotos: CC BY-SA 3.0 R. Jahn (BGBM).

Stephanodiscus minutulus

Stephanodiscus minutulus (Lichtmikroskop, REM). Fotos: CC BY-SA 3.0 R. Jahn (BGBM).

  

Liste der Taxa

Achnanthidium minutissimum (Kütz.) Czarn.

Cocconeis pediculus Ehrenb.

Cocconeis placentula Ehrenb.

Cyclotella meneghiniana Kütz.

Diatoma tenuis C.Agardh

Encyonema minutum (Hilse) D.G.Mann

Encyonema silesiacum (Bleisch) D.G.Mann

Eolimna minima (Grunow) Lange-Bert.

Fragilaria mesolepta Rabenh.

Gomphonema parvulum Kütz.

Hantzschia amphioxys (Ehrenb.) Grunow

Mayamaea atomus var. permitis (Hust.) Lange-Bert.

Melosira varians C.Agardh

Navicula cryptocephala Kütz.

Navicula gregaria Donkin

Navicula slesvicensis Grunow

Navicula tripunctata (O.F.Müll.) Bory

Nitzschia acicularis (Kütz.) W.Sm.

Nitzschia cf. fonticola "strain D15_023"

Nitzschia cf. semirobusta "strain D32_012"

Nitzschia dissipata (Kütz.) Rabenh.

Nitzschia inconspicua Grunow

Nitzschia linearis (C.Agardh) W.Sm.

Nitzschia sigmoidea (Nitzsch) W.Sm.

Pinnularia divergens W.Sm.

Stauroneis phoenicenteron (Nitzsch) Ehrenb.

Stephanodiscus minutulus (Kütz.) Cleve & Möller

 

[W.-H. Kusber & R. Jahn, 8.11.2011]

 

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